هاپلوگروپ B یکی از قدیمی ترین سلسله های کروموزومی Y در انسان است. هاپلوگروپ B تقریباً به طور انحصاری در آفریقا یافت می شودو انتشاری محدود در کشورهای عربی.
این خاندان احتمالاً اولین کسی بود که تقریباً در حدود 90-130 هزار سال پیش در سراسر آفریقا پراکنده شد. هاپلوگروپ B در فرکانس پایین در سراسر آفریقا ظاهر می شود اما بیشترین فراوانی در جمعیت پیگمی دارد.